助理教授
加拿大北极海洋微生物生态系统服务研究主席
地球观测科学、环境和地理中心
华莱士大厦 520 号
银娱优越会717大学
MB 温尼伯
R3T 2N2
eric.collins@umanitoba.ca
ORCID:0000-0002-5858-2395

网站:

http://cryomics.org/
谷歌学术

 

学术背景

麦吉尔银娱优越会717博士后研究员,加拿大天体生物学培训计划(2013)
麦克马斯特银娱优越会717博士后研究员,起源研究所 (2012)
博士华盛顿银娱优越会717:生物海洋学(2009)
硕士学位华盛顿银娱优越会717:生物海洋学(2006)
理学学士华盛顿州立银娱优越会717:生物化学和分子生物学 (2002)

教学

ENVR3140:水生生态系统服务

研究兴趣

柯林斯实验室致力于了解冰冻圈中微生物的起源、进化、分布和功能,包括细菌、古细菌、藻类、原生生物、真菌和病毒。利用高通量和实时 DNA 测序,我们进行元条形码、基因组学、宏基因组学、转录组学和元转录组学。我们还开发使用机器学习方法分析和可视化大型数据集的软件。

当前和最近的研究生

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维达纳吉,塔马利 理学硕士 0009-0000-3746-793X
涩江丽 理学硕士 0009-0008-6544-4311
卡兹米鲁克,扎哈尔 博士 0000-0001-8684-7672

 

近期重要出版物

鲍曼 KL、柯林斯 RE、阿加瑟 AM、兰博格 CH、哈默施密特 CR、考尔 D、杜邦 CL、克里斯滕森 GA、埃利亚斯 DA。北极和赤道太平洋汞循环基因的分布及其与汞形态的关系。湖沼学和海洋学。 2020 年 1 月;65:S310-20。

Kasanke CP、柯林斯 RE、Leigh MB。优势环丁砜降解红蕨属的鉴定和表征。通过稳定同位素探测与宏基因组学相结合。科学报告。 2019 年 2 月 28 日;9(1):1-9.

Ducluzeau AL、Tyson JR、柯林斯 RE、Snutch TP、哈塞特 BT。使用 Oxford Nanopore minION 和 Illumina HiSeq 系统对亚北极中霉菌 Sphaeroforma Sirkka 菌株 B5 进行基因组测序。微生物学资源公告。 2018 年 10 月 18 日;7(15).

Hop H、Bluhm BA、Melnikov IA、Poulin M、Vihtakari M、Collins RE、Gradinger R、Juul-Pedersen T、von Quillfeldt C。海冰生物群:摘自海冰生物群专家网络/CBMP 的北极海洋生物多样性状况报告。 PeerJ 预印本; 2018 年 4 月 2 日。

Fuchsman CA、Collins RE、Rocap G、Brazelton WJ。环境对细菌和古细菌之间水平基因转移的影响。皮尔·J. 2017 年 9 月 29 日;5:e3865。